 |
|
|
15.МБ.110. О конфигурациях электростатического поля в ионных каналах мембран
Дмитриев А.В., Барышников В.Г., Лузянин С.Е. 2 Ежегодная молодежная конференция ИБХФ-вузы "Биохимическая физика", Москва, 13-14 июня, 2002: Тезисы докладов. М.: Изд-во ИБХФ РАН. 2002, с. 3. Рус.
Проведено исследование влияния поверхностных зарядов мембраны, молекул объемной воды и ионов на распределение электростатического потенциала вдоль оси ионного канала мембраны. В качестве каналообразующих молекулярных структур использовались грамицидин А, калиевый канал из Rattus Norvegicus, калиевый канал из Streptomyces Lividans, порин из Rhodopseudomonas blastica, фосфопорин из E. Coli, порин матрикса из E. Coli. Атомные координаты данных молекулярных структур взяты из Банка белковых структур (Protein Data Bank). Осевой электростатический потенциал, создаваемый указанными структурами, оценивался по данным зарядов на атомах, исходя из значений параметров электростатических взаимодействий силового поля AMBER. Потенциал на оси канала, формируемый поверхностными зарядами мембраны, оценивался, исходя из данных о зарядах и геометрии полярных групп фосфолипидов. Электростатический потенциал на оси канала, обусловленный молекулами воды, рассчитывался в дипольном приближении и в представлении точечных зарядов на ее атомах. Проведен сравнительный анализ результатов обоих расчетов в различных осевых точках. При оценке поля, создаваемого ионами раствора, последние моделировались точечными зарядами. Проведен сравнительный анализ результирующих электростатических потенциалов вдоль осей различных каналов.
|
|
|
|
Для того, чтобы мы могли качественно предоставить Вам информацию, мы используем cookies, которые сохраняются на Вашем компьютере (сведения о местоположении; ip-адрес; тип, язык, версия ОС и браузера; тип устройства и разрешение его экрана; источник, откуда пришел на сайт пользователь; какие страницы открывает и на какие кнопки нажимает пользователь; эта же информация используется для обработки статистических данных использования сайта посредством интернет-сервисов Google Analytics и Яндекс.Метрика). Нажимая кнопку «СОГЛАСЕН», Вы подтверждаете то, что Вы проинформированы об использовании cookies на нашем сайте. Отключить cookies Вы можете в настройках своего браузера.
Сервер создается при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований
Не разрешается копирование
материалов и размещение на других Web-сайтах
Вебдизайн: Copyright (C) И. Миняйлова и В. Миняйлов
Copyright (C) Химический факультет МГУ
Написать письмо редактору
|
