Организация клетки. Структура клеток
Фракционирование клеточных структур
А. Выделение клеточных
органелл
Разработан ряд методик для исследования
изолированных отделов клетки. Для того чтобы выделить клеточные органеллы,
исследуемый образец измельчают и затем гомогенизируют в забуференной
среде с использованием гомогенизатора Поттера-Элведжема (тефлоновый пестик,
вращающийся в стеклянном цилиндре). Это сравнительно мягкий метод, который
особенно предпочтителен для выделения лабильных молекул и ультраструктур. Другие
методики разрушения клеток включают ферментативный лизис, разрушающий клеточные
стенки, или механическое разрушение замороженных тканей (размолом или с помощью
вращающихся ножей; под большим давлением; осмотическим шоком; многократным
чередованием замораживания и оттаивания).
Для выделения интактных органелл важно,
чтобы среда, в которой проводится гомогенизация, была изотонической, т.е.
осмотическое давление буфера должно соответствовать давлению внутри клетки. Если
раствор гипотоничен, органеллы будут «впитывать» дополнительную воду и лопнут, а
в гипертонических растворах они, напротив, сморщиваются.
Вслед за гомогенизацией следует фильтрование через марлю
для удаления интактных клеток и соединительных тканей. Собственно фракционирование
клеточных органелл проводится с помощью дифференциального центрифугирования,
т.е. центрифугирования при различных скоростях вращения ротора. При этом ступенчатое
увеличение центробежной силы (которую принято выражать величиной, кратной нормальному
ускорению свободного падения g = 9,81 м/с2, см. сс. 202-203)
приводит к последовательному осаждению различных органелл, т.е. их разделению
в соответствии с плотностью и размером.
Ядро седиментирует уже при
ускорении, достигаемом о помощью настольных центрифуг. Декантирование
супернатанта и тщательное повторное ресуспендирование осадка дает фракцию,
обогащенную клеточными ядрами. Однако эта фракция все еще содержит другие
клеточные компоненты в качестве примесей, например фрагменты
цитоскелета.
Частицы меньших размеров и менее
плотные, чем ядро, получают при воздействии на супернатант постепенно
увеличивающегося ускорения . Эта операция проводится на более мощных
центрифугах, таких, как высокоскоростные центрифуги с охлаждением и
ультрацентрифуги. Порядок освещения фракций следующий: митохондрии, затем
мембранные пузырьки (везикулы) и рибосомы. Супернатант
последнего центрифугирования представляет собой «цитозоль», т.е.
растворимые компоненты клетки, перешедшие при гомогенизации ткани в буферный
раствор.
Выделение клеточных органелл обычно
проводят при низких температурах (0-5°С) для того, чтобы уменьшить степень
деградации материала за счет реакций, катализируемых ферментами; последние
высвобождаются в процессе разрушения ткани. Добавление тиолов и хелатирующих
агентов необходимо для защиты функциональных SH-групп от
окисления.
Б.
Молекулы-маркеры
В процессе фракционирования важно
контролировать чистоту фракций. Присутствие в определенной фракции той или иной
органеллы и наличие других компонентов определяют с помощью
молекул-маркеров. Обычно это органеллоспецифичные ферменты
(ферменты-маркеры). Распределение ферментов-маркеров в клетке отражает
локализацию в ней соответствующих каталитических реакций. Более детально эти
вопросы обсуждаются в разделах, посвященных отдельным
органеллам.