Е.И. Беризовская, А.А. Ихалайнен, А.М. Антохин, В.Ф. Таранченко, В.М. Гончаров, Д.А. Митрофанов, А.В. Удинцев, А.В. Аксенов, О.А. Шевлякова¹, И.А. Родин, О.А. Шпигун

Методы обработки масс-спектрометрических данных при идентификации пептидов и белков

Перед началом идентификации пептидов и белков методом масс-спектрометрии, как правило, проводят ферментативное расщепление, а затем записывают масс-спектрометрические данные полученных пептидов. Применяют различные алгоритмы и программы для идентифицирования пептидов и белков с помощью поиска по базам данных и denovoсеквенирования. Рассмотрены основные используемые для этих целей программные продукты, кратко описаны базы данных.
Ключевые слова: масс-спектрометрия, ферментативное расщепление, системы поиска, базы данных, denovoсеквенирование.

  Полный текст статьи в формате PDF

Вестник Московского Университета.
Химия 2015, том 56, № 5, стр. 266-278