|
Анастасия Романовна Блинова, Анна Михайловна Кулакова, Белла Людвиговна Григоренко
Механизм депротонирования аминогруппы глутамата
при связывании с N-ацетилглутаматсинтазой
Реферат
Аннотация:
Gcn5-связанные N-ацетилтрансферазы катализируют перенос ацетильной группы на
первичную аминогруппу широкого класса субстратов. Депротонирование аминогруппы
при связывании с ферментом необходимо для активации нуклеофильной атаки на
субстрат. С помощью методов молекулярного моделирования и квантовой химии
рассмотрен процесс связывания глутамата с N-ацетилглутаматсинтазой. Показано,
что депротонирование первичной аминогруппы глутамата происходит по мере его
встраивания в активный центр фермента при участии боковой цепи остатка
аспартата.
Ключевые слова: ацетилтрансферазы, протонированная
форма, молекулярная динамика, КМ/ММ, энергия Гиббса
DOI:
10.55959/MSU0579-9384-2-2024-65-4-312-318
 Полный текст статьи в формате PDF
Вестник Московского Университета.
Химия 2024, том 65, № 4, стр. 312-318
Copyright (C) Химический факультет МГУ, 2024
|
