Основанием для регистрации ХС является запись кода ее формализованного представления в таблице “ХИО – ХС”. Дополнительные вычисляемые атрибуты – короткий хэш-код и код молекулярных дескрипторов – служат для повышения эффективности доступа к химико-структурным данным.

Для унифицированного представления элементов ХС, формирования англо-русских систематических названий регистрируемых химических веществ в регистре предусмотрена отдельная таблица определения различных типов структурных фрагментов. Стандартные типы фрагментов отвечают различным задачам установления структурно-подструктурного соответствия:

• по фрагментам структуры (возможные заместители фрагмента – любые);
• по обязательной (не варьируемой) части формулы Маркуша (только заместители по местам посадки радикалов – любые);
• по радикалам-заместителям (только заместители по местам присоединения радикала к ХС – любые).

Поиск-регистрация химических структур является ключевым этапом в распознавании и регистрации других ХИО в области материальной химии. Эта процедура включает следующие операции:

• экстракция химико-структурных данных в идентифицируемых форматах представления ХС и/или их формализация в рамках редактора структурных данных, включенного в программные средства пользовательского интерфейса БД регистров;
• определение кодов (массивов индексов) фрагментов ХС, вычисление кодов генерируемых дескрипторов ХС и хэш-кода;
• фильтрация ХС, установление структурного соответствия, а при необходимости и автоматизированный и/или ручной сопоставительный контроль качества графического (координатного) представления и стереодескрипторов совпадающих ХС;
• нахождение заданной ХС, обновление или создание новой записи ХС с обновлением или созданием релевантных записей в таблицах определений элементов данных, форматов и структурных фрагментов ХС;
• для обобщенного ХС – создание новой записи в соответствующей таблице.

Для всех зарегистрированных ХС устанавливается соотношение “обобщенные ХС – ХС” – разметка регистра ХС путем генерации соответствующих записей в таблице “Маркуш-классы – ХС”. Введение процедуры автоматической разметки БД регистра ХС позволяет на ее основе наиболее полно формализовать и использовать информацию по обобщенным соединениям в патентных и научно-методических документах как для решения задач поиска/классификации, так и восстановления пропущенных данных, верификации и синтеза информации.

Концептуальной основой создания регистра ХС, с одной стороны, явилось формирование определений для создания регистров других ХИО в области материальной и реакционной химии. С другой стороны, разработанный прототип регистра ХС имеет самостоятельное значение как для фундаментальных исследований в области химии, так и для прикладных информационно-аналитических и патентных исследований.